USB3 wird aber erst von gaaaanz neuen Macs unterstützt.

Ohne eigene Erfahrung mit Thunderbolt sage ich mal aus dem Bauch heraus, dass bei normalen Festplatten (also mit drehenden Magnetscheiben) der Geschwindigkeitsvorteil von Thunderbolt gegenüber Firewire 800 gering sein dürfte, da die Festplatte selbst meist nicht wesentlich schneller ist, als über Firewire 800 übertragen werden kann. Anders dürfte es da bei SSD aussehen, da diese durch Firewire stark ausgebremst werden.