Die D3100 ist eben das neuere Modell und die Sensortechnik hat sich hoffentlich eher verbessert als verschlechtert. Wenn Du "kaum als Hobby-Fotograf" zu bezeichnen bist werden Dich Unterschiede im Detail wie beispielsweise Belichtungsreihen wenig interessieren (dies würde für die D5000 sprechen).

Die D5000 hat das kleinere, aber schwenkbare Display. Letzteres benötige ich jedenfalls nicht wirklich und würde daher zum größeren Display tendieren - das ist aber auch eine persönliche Entscheidung.

Also leichte Tendenz zur D3100 aber im Endeffekt wenig Unterschied. Die Größe ist natürlich auch ein Faktum und es wäre daher nicht verkehrt, Dir die Kameras mal live anzusehen und zu beurteilen welche Dir hier besser (in der Hand) liegt ...