Was Gerhard geschrieben hat, ist absolut korrekt! Besonders bei sehr teuren Programmen, wie AutoCAD, ist es eher unwahrscheinlich, dass viele Leute die Software besitzen.
Der Adobe Reader jedoch ist kostenlos und ohnehin fast überall vorhanden.

Hinzu kommt noch, das es beim Drucken der Dateien programmabhängig oft unzählige Möglichkeiten zum Einstellen gibt - was den Druck unnötig kompliziert und zusätzliche Kosten (Arbeitszeit) verursacht.

Dem kann man schon vorbeugen, wenn man die nötigen Einstellungen auf dem eigenen PC vornimmt und in die PDF- Datei einbettet (druckt).

Word im speziellen ist ein Programm, das zwar nicht sooo teuer und ungewöhnlich ist, als dass es eine Druckerei nicht besitzen würde (gehört zum Standard), aber dieses Programm neigt dazu, auf fremden Rechnern "von selbst" entscheidende Formatierungen zu verändern - was das bei einer Doktorarbeit von 250 Seiten bedeutet, kann sich jeder selber denken.

Dem lässt sich mit einer PDF Datei prima vorbeugen.

Zu Deiner Frage kann ich leider nichts beitragen, da ich nicht weiß, mit welchen Einstellungen die PDFs jeweils erzeugt wurden.