Ich speichere die Datei bevor ich Excel schließe, damit muss ich die Frage beim Schließen nicht beantworten (und kann da auch keinen Fehler machen). Dabei wird kurzfristig eine temporäre Datei angelegt, die aber sofort wieder verschwindet (nach etwa zwei Sekunden). Danach ist die aktualisierte Datei unter dem alten Namen wieder verfügbar.

Zu den Verknüpfungen kann ich auch nichts sagen.