Da hier nicht allzu viele Antworten kommen und ich schon öfters dort war (meine Frau ist aus Peru) versuche ich es mal.

a.) deine Auswahl ist schon mal nicht schlecht und besser wenige Dinge intensiver zu genießen als von einem Ort zum anderen zu hetzten. Wie kommst du nach Arequipa und Cusco, Flug oder Bus?

b.) gute Grundkenntnisse sind auf jeden fall sehr empfehlenswert

c.) d.) die üblichen in solchen Ländern, einfach etwas Vorsicht walten lassen.
Die Unterkunft möglichst im Zentrum bei der Plaza de armas (Hauptplatz), da kannst du dann auch am Abend ohne allzu großer Gefahr ausgehen. Wegen Vergewaltigungen brauchst du dir keine Sorgen machen, Überfälle sind da eher ein Thema. Deshalb die Wertsachen immer an mehreren Stellen am Körper verteilen. Falls es passiert dann einfach einiges abgeben und nicht wehren.

Deshalb empfehle ich alle Ausflüge mit einem Guide zu machen, kostet zwar was aber ihr seid beruhigt und könnt euch auf die Sehenswürdigkeiten konzentrieren.

e.) auch wenn du auf all das verzichtest bist du aus 200m als Gringo zu erkennen. Ich nehme auf solche Reisen keine SLR mit da es mir persönlich zu anstrengend ist. Und am Körper tragen nützt dir auch nichts wenn der andere ein Messer hat, aber lass dich nicht verrückt machen.

f.) Das kommt ganz auf die Gegend an, Peru hat fast alle Klimazonen der Erde und es ist auch ein extremer Unterschied zwischen Küste und Berge. Deine Zeit ist nicht so schlecht, es ist Herbstbeginn und die Regenfälle in den Bergen werden gerade weniger. Du musst nur in Cusco und Machu Picchu mit einigen Regenfällen rechnen, aber kein Dauerregen. Auf was du achten musst ist die Sonne, die UV Strahlung ist auch bei bedecktem Himmel extrem stark.

Ich hoffe das hilft dir etwas und du kannst die Reise genießen.